Desarrollar investigación teórica y aplicada en sistemas sociales complejos de la Región, con énfasis en la utilización de metodologías sistémicas transdisciplinarias como la cibernética y la sistemología interpretativa.
Esto se debe a que las problemáticas complejas de la Región no se pueden encasillar en el ámbito particular de una sola o varias disciplinas del saber. Por ello MYSCO ha adoptado un enfoque transdisciplinario, el cual está a su vez contribuyendo a desarrollar.
Llegar a convertirse en un centro de investigaciones de sistemas complejos, que impulse el desarrollo del pensamiento sistémico latinoamericano enfocado en los complejos problemas de nuestra región. Dicho centro llevará a cabo una labor de formación de nuevas generaciones de investigadores y pensadores sistémicos a través de una Maestría y un Doctorado en Pensamiento Sistémico.